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演讲题目 估计Salmonid从太平洋西北流使用多基因遗传多样性埃德娜Metabarcodingbob娱官网入口
展示作者姓名 凯文Weitemier
展示作者联系 俄勒冈州立大学
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部门会议 西方的部门/ WA-BC章节
一般主题 Salmonid埃德娜
类型的演讲 口服
文摘

使用环境DNA(埃德娜)是迅速发展的一种量化的方法在各种生态系统物种存在。随着技术的进步,特别是使用metabarcoding和高通量测序,埃德娜正越来越多地用来推断种群丰度估计和人口健康的指标。在这里,我们使用多基因序列数据大型化埃德娜检查线粒体遗传多样性的四大马哈鱼(虹鳟鱼、沿海切喉鳟、大鳞大麻哈鱼和银鲑鱼)16个位置8在俄勒冈州和加州北部水域。我们的多基因小组包括三个目标常用的人口基因(阐述),系统(COI)和埃德娜(12 s核糖体DNA)筛选。codon-informed后去噪过程减少假单,线粒体轨迹阐述显示最大的物种内部单体型相比COI或12 s rDNA多样性。对于切喉鳟而言,最大的多样性被发现在沿海水域流。网站在威拉米特河,姆普夸,流氓河流域要么没有共享单,或高度不同的等位基因频率。的数量和频率分布阐述单发现(21)显示一致的最近的一项调查从88年沿海切喉鳟个人阐述序列。虹鳟鱼,遗传多样性最高的被发现在小溪流中微处理机河流域和沿海水域,较低的多样性姆普夸河流域。银大马哈鱼只有在克拉马斯河沿岸流和分水岭,与沿海流之间的多样性大大超过了克拉马斯语。 Chinook Salmon were only observed in the Willamette watershed, with multiple haplotypes observed at each locus. The characterization of diversity at multiple genetic loci from eDNA samples expands the knowledge gained from this technique, and provides additional information for data-driven prioritization of management and conservation actions for multiple aquatic species.

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