鱼类生物学方法，第2版

第七章:系统地理学与群体遗传分析基础

Michelle R. Gaither和Joseph D. DiBattista

doi:https://doi.org/10.47886/9781934874615.ch7

Gaither, m.r.和j.d. DiBattista。2022.系统地理学与群体遗传分析基础。207 - 245页在S. Midway, C. Hasler和P. Chakrabarty，编辑。鱼类生物学方法，2^nd版。美国渔业协会，马里BOB国际体育兰州贝塞斯达。

术语"phylogeography这个词最早是三十多年前由Avise等人(1987)提出的;从那时起，该领域发表的文章数量(见Avise 2000:图1.5)呈指数级增长。系统地理学作为生物地理学的一个分支学科，是研究影响生物多样性在空间和时间上分布的非生物因素和进化过程的学科。它是一个动态的跨学科领域，涉及地质学、地理学、进化论和生态学。它与更广泛的生物地理学领域的不同之处在于，它关注的是种内水平的遗传谱系模式和多样性(Avise 1998,2000)。在全球和区域尺度上，比较系统地理学研究为形成生物多样性模式和不同种群的过程提供了重要的见解(Bernatchez and Wilson 1998;Bowen et al. 2001, 2016;Gaither et al. 2010, 2016a;Gaither和Rocha 2013;克兰德尔等人，2019)。 These approaches have been employed to identify genetically isolated populations in peripheral locations such as the Hawaiian Archipelago (Gaither et al. 2011b), the Tropical Eastern Pacific (Lessios and Robertson 2006), the Red Sea (DiBattista et al. 2016a, 2016b, 2017c), and the Sea of Cortez (Terry et al. 2000) and are often used to identify signatures of population structure that result from disjunct habitats (antitropical species; Bowen and Grant 1997; Grant et al. 2005; Box 7.1) or contrasting environmental conditions (von der Heyden et al. 2013; Gaither et al. 2015a, 2016b; Teske et al. 2019). Moreover, many studies have applied panels of微卫星基因座而且单核苷酸多态性(单核苷酸多态性)来监测种群组成和划定保护单元(鲑鱼的例子包括Seeb等人，2011;Larson等，2014;Bradbury et al. 2015)。