鱼类生物学方法，第2版
第五章:鱼类的系统发育系统学
Dahiana Arcila和Guillermo Ortí
doi:https://doi.org/10.47886/9781934874615.ch5
阿奇拉，D, G. Ortí。2022.鱼类系统发育系统学。117 - 152页在S. Midway, C. Hasler和P. Chakrabarty，编辑。鱼类生物学方法，2nd版。美国渔业协会，马里BOB国际体育兰州贝塞斯达。
在奥陶世早期(约4.8亿年前[mya])在浅海栖息地建立了相当不起眼的存在之后，鱼类已经扩散到几乎所有可能的水生栖息地，展示了一系列壮观的形态和生理适应(Nelson 2006;Wainwright and Longo 2017;萨伦等人，2018)。目前，鱼类是现存脊椎动物中物种最丰富的群体，有超过35000种。考虑到我们通常所说的“鱼类”并没有形成一个自然的分类组合(即它们不是一种鱼类)单元组)，它们的不同形式被适当地划分为三个不同的组(Nelson 2006;Nelson et al. 2016):(1)环口鱼(无颚鱼)约有123种现存物种，包括盲鳗和七鳃鳗;(2)软骨鱼目(软骨鱼类)包括超过940种，以嵌合体、鲨鱼和鳐鱼为代表;(3)硬骨鱼类(硬骨鱼类)包括超过34000种，包括鳍鳍鱼类(放线鱼)和两个鳍鳍鱼类谱系(肺鱼和腔棘鱼，但不包括四足动物;它们都被放在肉片里;图5.1)。可以追溯到18世纪早期Artedi和Linnaeus的研究，鱼类多样性已经根据外部形态特征和内部解剖进行了编目，建立了一个长期的传统来研究主要谱系的进化，并确定了许多今天仍然公认的演化支(Carroll 1988;Janvier 1996)。然而，最近，由于分子证据的涌入，目前鱼类分类的结构发生了重大变化(Betancur-R。Et al. 2013a, 2017)，这是本章将涉及的概念和方法发展的结果。 Figure 5.1 displays the current classification of fishes based on molecular characters. Although much of the structure of this系统分类已经得到形态学研究的支持，大多数percomorph类群现在被划分为系列(例如，Pelagiaria, Syngnatharia, Anabantaria, Carangaria, Ovalentaria和Eupercaria)，它们之间的相互关系只有根据分子证据才可能。最终，对进化的全面理解需要整合多种信息来源，不仅包括表型数据，还包括遗传学以及对化石和现存物种的分析。为了实现这种整合，在过去的几十年里，鱼类系统学领域吸收了越来越多的分子、形态和定量方法进行系统发育重建(Meyer和Zardoya 2003;Mabee et al. 2007;Hilton et al. 2015;Lee和Palci 2015)。